MALDI-TOF，中文全称基质辅助激光解吸飞行质谱，主要由基质辅助激光解吸电离离子源MALDI和飞行时间质量分析器(TOF)两部分组成。其原理是样品分子分散在基质分子中形成共结晶，激光照射时，基质从激光中吸收能量，传递给样品分子，使其瞬间汽化，并将质子转移到样品分子使其离子化，然后进入飞行时间质量分析器，根据它们各自的质荷比(m/z)进行检测。

仪器的核心被称为MALDI（基质辅助激光解吸）是一种软电离技术，由激光解吸（LD）发展而来，解决激光解吸难挥发和热不稳定高分子样品的离子化问题，具有灵敏度高、适用范围广、操作简单等特点，使传统的主要用于小分子物质研究的质谱技术拓展到分析高极性、难挥发和热不稳定样品的范围。应对蛋白质、多肽等热不稳定的大分子物质的电离，使其符合进行质量分析的要求。

飞行时间质谱TOF（Time of Flight Mass Spectrometer）是一种很常用的质谱仪。质谱是一种通过测定带电离子质量/电荷比(m/z，简称质荷比)而进行定性、定量检测的一种现代分析技术，具备高特异性和高灵敏度，且得到了广泛应用的普适性方法。飞行时间质谱仪可检测的分子量范围大，扫描速度快，仪器结构简单。

将分离技术与质谱法相结合是分离科学方法中的一项突破性进展。基质辅助激光解吸飞行质谱MALDI-TOF更是具有分析快速、灵敏度高，高通量等优点。选择常用的测试基质为CHCA、DHB、SA等，以及常用的测试溶剂为水、甲醇、二氯甲烷、氯仿、乙酸乙酯、四氢呋喃、丙酮、乙醚、甲苯等即可利用检测仪器分析肽、脂质、糖类或其他有机大分子等生物分子。

基质辅助激光解吸飞行质谱MALDI-TOF能够快速测定生物大分子和高分子的分子量。由于仪器昂贵，一次性投入成本高，批量的应用目前尚未普及，但在生物大分子方面的应用越来越受到关注，随着更合适的机制的发现和仪器对样品分子的分辨率与检测灵敏度的进一步的改善，基质辅助激光解吸飞行质谱MALDI-TOF必将在生物化学，药物化学，药化分析，高分子分子量，分子量分布以及其它结构信息测定等多方面发挥更重要的作用。